SOPHiA DDM ™ для солидных опухолей

SOPHiA DDM ™ для солидных опухолей

Категория:

Консультация с нашим специалистом

+38 (044) 323-07-90

Описание

https://www.sophiagenetics.com/clinical/oncology/solid-tumors/

геномное профилирование способствует точной онкологии. От целенаправленных до комплексных решений, секвенирование следующего поколения (NGS) предлагает возможность одновременно анализировать определенный набор генов, регионов и биомаркеров на основе известного влияния на солидную опухоль. Анализируются такие ткани: легкие, толстая кишка, молочная железа, меланома, желудок и рак яичников. Однако, поскольку тесты или расширяются, или становятся более специализированными, молекулярные патологи теперь полагаются на решения, оптимизированные с учетом уникальных параметров каждого эксперимента, поэтому они могут быстро получить ответы, которые им нужны.

Адаптация к изменениям качества, количества и неоднородности исходного материала

Точное выявление соматических вариантов в образцах опухолей не является тривиальной задачей. Качество и количество исходного материала часто ухудшают надежный вариант вызова. Наша технология учитывает такие факторы как дезаминирование, фрагментация ДНК и внутренне опухолевая неоднородность. И ориентирована на максимальное увеличение шансов выявления вариантов. Алгоритм разработан для достижения высокой пропускной способности, уменьшение ложноположительных результатов и выявления трудно прикрытых вариантов (таких как промотор TERT и экзон 14МЕТ) даже с некачественным вводным материалом.

 

Рисунок 2. Сравнение SOPHiA DDM ™ для TSO500 и SOPHiA DDM ™ для выявления слияния TST170 со стандартным решением — на основе анализа 65 решений по 105 клинических и справочных образцов (источник: данные в файле)

Балансовый предел определения, шума, глубины секвенирования для оптимальной способности вторичного анализа

Предполагается, что увеличение глубины секвенирования автоматически позволяет снизить уровень обнаружения. Однако реальность сложнее. Наша технология учитывает сложные параметры вызова вариантов твердой опухоли и определяет сигнал вне шумом, поэтому варианты отличаются от артефактов. Независимо от того, вызываются SNV, Indels, сплавы или CNV, наши алгоритмы обнаружения адаптированы к каждому эксперименту, чтобы получить ценную информацию.

Включение третичного анализа с соответствующей информацией, подтверждающий принятие решений

По мере прогрессирования молекулярного картографирования солидных опухолей субпопуляции рака эволюционируют и фрагментируются. Независимо от того, проанализированы 10 или 500 вариантов, платформа SOPHiA DDM ™ помогает пользователям немедленно сосредоточиться на соответствующих и эффективных геномных изменениях. Некоторые функции облегчают процесс их интерпретации: проверка «горячих точек», предварительная классификация вариантов с поддержкой алгоритма, полностью настраиваемые фильтры и модуль Oncoportal ™. OncoPortal ™ предоставляет новейшие научные доказательства и указания относительно действий и значение каждого геномного изменения для поддержки обоснованных решений для исследовательских целей.

https://www.sophiagenetics.com/clinical/oncology/solid-tumors/ 

Детали

Бренди

Отзывы

Отзывов пока нет.

Будьте первым, кто оставил отзыв на “SOPHiA DDM ™ для солидных опухолей”

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *